Фамилия Кубынин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Кубыня восходит к слову «кубыня» - «узкогорлая посудина с раздутыми боками; глиняный, пережабистый в горле кувшин; бутылка, фляга, пузыристая склянка; кожаный или деревянный дорожный сосуд для питья». Поэтому можно предположить, что основатель рода Кубыниных занимался изготовлением посуды. Однако не исключено, что прозвище Кубыня носил плотный коротыш, толстячок. Следует отметить, что подобные прозвища в старину воспринимались достаточно спокойно, т.к. полнота считалась признаком здоровья, достатка. В старину родственные прозвища были довольно популярны. Веселовского записаны: Кубышка Василий, крестьянин, 1593 г., Арзамас; Кубышкин Иван, крестьянин, 1634 г., Нижний Новгород. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кубыня, со временем получил фамилию Кубынин. О точном месте и времени возникновения фамилии Кубынин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Кубынин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.