Фамилия Кубышева образована от мужского прозвища Кубыш. В основе прозвища лежит слово «кубышка» — так в старину называли небольшой сосуд с узким горлом и раздутыми боками: глиняный кувшин, дорожную флягу или бутылку. Скорее всего, прозвище Кубыш относилось к «профессиональным» именованиям и указывало на ремесло человека — изготовление глиняной или деревянной посуды. Однако у слова было и переносное значение: кубышкой в народе называли плотного, невысокого человека, толстячка. В те времена полнота не считалась недостатком — наоборот, она говорила о здоровье и достатке, поэтому такое прозвище не было обидным и легко закреплялось за человеком.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ев (в основу легла форма Кубыш, а не Кубышка). Это патронимическая фамилия: Кубышев — буквально «сын Кубыша». Со временем прозвище перестало быть личным именованием и перешло в разряд наследственных фамилий. Женская форма Кубышева указывает на то, что речь идёт о представительнице рода Кубышевых.

Интересно, что фамилия Кубышев встречается нечасто и имеет локальный характер. Её географическая привязка — преимущественно южнорусские регионы, где слово «кубышка» было особенно употребительно. В отличие от более распространённых фамилий на -ов, образованных от имён и профессий, Кубышев сохраняет прямую связь с конкретным предметом быта, что делает её своеобразным маркером народной культуры. Родственные фамилии — Кубышкин, Кубышко, Кубыш — образованы от того же корня, но с разными суффиксами, что говорит о гибкости прозвищной системы в прошлом.