Фамилия Кубышта — редкая и неочевидная для русского уха, и её происхождение ведёт не в славянские земли, а на Кавказ, точнее — в Абхазию. Это пример фамилии, которая сохранила исходное звучание и не прошла через типичную русскую словообразовательную обработку (суффиксы -ов, -ин, -ский ей не понадобились). Основа «Кубыш» или «Кубышт» легко угадывается в абхазской фамилии Кубыш-иа (Кубыш-ба), где -ба — патронимический суффикс, означающий «сын» или «потомок». Со временем, при переходе в русскоязычную среду, окончание могло редуцироваться, и фамилия закрепилась в форме Кубышта.

Значение корня «Кубыш» спорно, но наиболее правдоподобная версия связывает его с абхазским словом «а-кубыш» — «кувшин» или «сосуд». В таком случае прозвище предка могло относиться к гончару, торговцу посудой или просто к человеку с характерной внешностью (например, с округлой фигурой). Менее убедительна гипотеза о тюркском следе (от «кубыш» — «мешок»), так как для абхазского ареала типичнее именно местная лексика.

Географически фамилия Кубышта привязана к западному Кавказу, в первую очередь к Абхазии и прилегающим районам Краснодарского края. Встречается она и среди русских носителей, но в таких случаях это, скорее всего, результат смешанных браков или усыновления фамилии при переезде. В дореволюционных списках эта фамилия почти не фиксируется — она стала заметна в советское время, когда паспортизация закрепила национальные фамилии в их живом произношении.

Социальный контекст: носители фамилии Кубышта в основном происходят из крестьянского или ремесленного сословия, без связи с дворянскими родами. Это фамилия-прозвище, которая говорит о занятии или бытовой детали, а не о знатности. Сравнение с однокоренными фамилиями — Кубышкин, Кубышко — показывает, что русская версия пошла по пути суффиксации, а Кубышта сохранила исходную кавказскую форму, что делает её особенно интересной для тех, кто ищет свои корни за пределами центральной России.