Фамилия Кудачин образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей — с помощью суффикса -ин, который присоединялся к основам, оканчивающимся на -а или -я. В данном случае основа — Кудача. Это краткая, обиходная форма имени или прозвища.

Что скрывается за словом «Кудача»? Здесь возможны два основных пути. Первый и самый прямой — связь с глаголом «кудесить» или «кудачить» (в некоторых говорах — колдовать, ворожить, напускать порчу). Тогда Кудачей могли прозвать знахаря, ворожея или просто человека со странным, необъяснимым поведением. Второй, не менее вероятный вариант — происхождение от крестильного имени Никодим. В народной речи это имя сокращали до Кодя, Кудим, Кудимка, а от «Кудим» легко появляется уменьшительная форма Кудача. По такому же принципу из имени Фаддей получились фамилии Фадеев и Фадин, а из Ермолай — Ермолаев и Ермошин. Имя Никодим (в переводе с греческого — «побеждающий народ») было достаточно популярно в крестьянской среде, особенно в XIX веке.

Суффикс -ин чётко указывает на то, что фамилия сформировалась в северных и центральных русских землях, а также в Сибири, куда переселенцы принесли эту модель. В южнорусских и украинских регионах чаще встречались бы варианты на -енко или -ов.

Менее правдоподобна, но всё же возможна связь со словом «кудакать» — подражать крику кукушки или, в переносном смысле, болтать без умолку. Однако в говорах этот глагол редок, и основная масса носителей фамилии, скорее всего, ведёт род от человека по прозвищу Кудача — либо знахаря, либо Никодима в бытовом переименовании.

Встречается фамилия нечасто, сосредоточена в основном в Поволжье и на Урале. Социальный состав предков — вероятнее всего, государственные крестьяне или однодворцы, у которых фамилии закрепились в XVIII–XIX веках. Дворянских родов Кудачиных в исторических списках не значится.