Фамилия Кудьярова — это фонетический вариант более распространённой фамилии Кудиярова. Разница в написании связана с особенностями произношения: в русских говорах после твёрдого согласного звук [у] мог звучать как [ы], что и закрепилось на письме. Основа фамилии — восточное имя Кудияр, которое состоит из двух корней. Первый — древнетюркско-татарское «куда», то есть «кум, сват», второй — персидское «яр», означающее «близкий человек, друг, помощник». Такое имя в прошлом давали с пожеланием, чтобы у ребёнка была большая семья и верные друзья.

Фамилия встречается в документах, в том числе в Книге памяти Иркутской области. Там указан священник Кудьяров Николай Осипович, родившийся в 1895 году в городе Витим в Якутии. Эта запись показывает, что носители фамилии могли принадлежать к духовному сословию и жить далеко за Уралом.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов присоединяется к основе имени отца. Так потомка человека по имени Кудьяр стали называть Кудьяровым. Фамилия сохранила память о восточных корнях предка и о том, как имя, данное при рождении, превратилось в родовое прозвание.