Фамилия Кудюкина — женская форма фамилии Кудюкин, и её разбор стоит начать с вопроса, который сразу возникает у любого, кто с ней сталкивается: откуда взялся корень «кудюк»? В русском языке такого слова нет, и это первый ключ к происхождению.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Кудюк, образованное от диалектного глагола «кудюкать» или «кудючить». В ряде южнорусских и украинских говоров это означало «ворчать», «брюзжать», «говорить невнятно» или «нашептывать». Человек с таким прозвищем мог быть неразговорчивым, вечно недовольным или, наоборот, тем, кто бормочет себе под нос. Модель образования типична: к глагольной основе добавили суффикс -юк-, который в восточнославянских фамилиях часто указывает на признак по действию или характеру (сравните: Молчун — Молчунов, Ворчун — Ворчунов). Суффикс -ин в окончании — стандартный русский патронимический показатель, отвечающий на вопрос «чей?»: Кудюкин — сын Кудюка.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с тюркским словом «кудюк» (колодец, источник). В этом случае прозвище мог получить человек, живший у колодца или копавший их. Но для русских фамилий такая основа редка, и первое объяснение — от глагола со значением «ворчать» — выглядит убедительнее, поскольку опирается на живую диалектную лексику.

Интересно, что фамилия Кудюкин не слишком распространена. Встречается она преимущественно в центральных и южных областях России, а также на Украине, что совпадает с ареалом бытования тех самых говоров, где «кудюкать» было в ходу. Никакой связи с дворянскими родами или известными историческими личностями у неё нет — это типичная крестьянская или мещанская фамилия, образованная от уличного прозвища. Её носители, скорее всего, были простыми людьми, которых в деревне знали по характерной черте — привычке ворчать или говорить неразборчиво.