Фамилия Куфтин образована от прозвища Куфта. Его основа — слово «куфта» или «куфтырь», которое в русских говорах обозначало свёрток кудели, узел с одеждой или моток тесёмок и шёлка. Есть и версия, что это слово родственно «куфтерь» — так называли дорогую восточную, турецкую шёлковую ткань. Отсюда и два вероятных портрета предка: либо это был торговец тканями, хорошо знавший товар, либо человек, который выделялся тем, что носил одежду из такого шёлка. В любом случае прозвище было профессиональным или характеризующим, а не случайным.

Суффикс -ин в фамилии Куфтин указывает на принадлежность: «чей?» — Куфтин, то есть сын или потомок Куфты. По такой модели образованы многие русские фамилии от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а. Слово «куфта» не было широко распространённым, поэтому фамилия встречается нечасто и сохранилась преимущественно в центральных и северных областях России, где диалектная лексика была устойчивее. В отличие от более частых «торговых» фамилий вроде Купцов или Ткачёв, Куфтин напрямую отсылает к конкретному предмету обихода или ткани, что делает её более узкой по происхождению.