Фамилия Куклин, как и многие русские фамилии, родилась из прозвища. Её основа — слово «куколь», которое в древнерусском языке имело сразу несколько значений, и это делает этимологию особенно интересной.

Словом «куколь» называли сорное растение с красивыми, но ядовитыми семенами. Однако в быту у этого слова было другое, более ходовое значение — головной убор. Куколь — это и монашеский клобук, и особый капюшон, который на Русском Севере надевали вместо накомарника для защиты от гнуса. Прозвище Куколь мог получить человек, который шил такие плащи и капюшоны, либо тот, кто их постоянно носил. Есть и третья версия: «куколь» в некоторых говорах означало «кукла», поэтому прозвище могло закрепиться за мастером-игрушечником.

При образовании фамилии произошло типичное для русского языка выпадение гласного: основа «Куколь» потеряла беглое О, и к ней добавился патронимический суффикс -ин. Таким образом, Куклин — это буквально «сын Куколя». По модели образования фамилия относится к самому распространённому в России типу, но её корень редок и уводит нас не в мир боярских родов, а в толщу народных ремёсел и крестьянского быта.