Фамилия Кунаккова — женская форма фамилии Кунакков. В русской традиции фамилии на -ов/-ев образуются от мужских прозвищ или имен, а окончание -а указывает на принадлежность женщине. В основе лежит слово «кунак» — тюркское заимствование, распространенное на Кавказе и в Поволжье. Кунаком называли друга, побратима или гостя, с которым заключали особый союз гостеприимства. У народов Кавказа и татар куначество было важным социальным институтом: кунак считался почти родственником, за его жизнь и честь ручались.

Фамилия Кунакков (и ее производные) типична для регионов, где тюркские языки смешивались с русским: Татарстан, Башкортостан, Оренбуржье, а также для казачества, которое переняло обычаи куначества. Предок носителя фамилии мог получить прозвище Кунак за гостеприимство, за то, что часто принимал путников, или потому, что сам был пришлым человеком, которого «прикуначили» — приняли в чужом роду. Встречается и версия, что прозвище давали ребенку, родившемуся в доме, где гостил кунак, — как знак особого события.

Суффикс -ов в фамилии Кунакков — стандартный русский патронимический формант, указывающий на принадлежность к роду Кунака. Интересно, что в некоторых тюркских языках слово «кунак» также имеет значение «свекор» или «тесть», что добавляет еще один возможный оттенок: прозвище могло закрепиться за человеком, который породнился через брак дочери. Однако для русской фамилии первично все же значение «друг-побратим» — оно шире распространено в бытовом обиходе.

Фамилия не относится к числу дворянских или княжеских — это типичная крестьянская или казачья фамилия, возникшая в XVI–XVII веках, когда прозвища начали закрепляться в качестве наследственных. В документах Кунакковы встречаются в основном в списках однодворцев, казаков и государственных крестьян южных и восточных губерний России. Сегодня фамилия редкая, но устойчиво сохраняется в Татарстане и Оренбургской области.