Фамилия Кунгурина образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Кунгурин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Кунгура. Женская форма Кунгурина — это вариант, закреплённый за носительницей, исторически же фамилия в мужском роде звучала бы как Кунгурин, хотя в быту и документах встречается и Кунгуров (с суффиксом -ов). Основа здесь — прозвище или имя Кунгура, которое напрямую связано с топонимом Кунгур — городом в Пермском крае.

Кунгур — один из старейших городов Урала, основанный в середине XVII века. Прозвище Кунгура могли дать человеку, который пришёл из этого города, торговал с кунгуряками или имел там родню. В русской ономастике такие «географические» прозвища — обычное дело: Рязань, Москва, Тверь легко превращались в фамилии (Рязанов, Москвин, Тверитин). Кунгурин — пример уральской фамилии, которая закрепилась в регионах, куда переселялись жители Кунгура: на Урале, в Сибири и Поволжье.

Важно уточнить, что слово «кунгура» в русских говорах не зафиксировано как нарицательное. Есть версия, что прозвище могло возникнуть от тюркского «кун» (солнце) или «кунгур» (тёмный, смуглый), но это предположение слабое: город Кунгур получил имя по реке Кунгурке, а название реки, скорее всего, из коми-пермяцкого языка, где «кун» означает «глухой, далёкий». Поэтому связь с Уралом — самая прямая и правдоподобная.

По сословному составу Кунгурины в основном были крестьянами и мещанами, реже — купцами, учитывая торговый характер самого Кунгура. В архивных записях XVIII–XIX веков фамилия встречается в Пермской и Вятской губерниях. Носителей с дворянским титулом не отмечено — это типичная «народная» фамилия, которая закрепилась через отчество от прозвища.

С точки зрения словообразования фамилия проста: основа Кунгур- плюс суффикс -ин, который в русском языке часто присоединяется к основам на -а, -я (сравните: Кузьма — Кузьмин, Илья — Ильин). Кунгура — это форма мужского прозвища, оканчивающегося на -а, что характерно для северных и уральских говоров. Если бы основа была Кунгур (без окончания), фамилия звучала бы как Кунгуров, и такие варианты действительно встречаются, но реже.

Таким образом, фамилия Кунгурина — это «географическое» отчество, указывающее на связь предка с городом Кунгур. Она не содержит редких или спорных элементов, но даёт чёткую привязку к уральскому региону и истории освоения Прикамья.