Фамилия Кунин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. В основе прозвища Куня лежит слово «куница». Вероятно, прозвище Куня могло относиться к ловкому и опытному охотнику, занимавшемуся отловом куниц. Не исключено, что прозвище Куня связано с диалектным глаголом «кунять» - «дремать сидя, клевать носом». В этом случае, Куней могли прозвать соню, лежебоку. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Куня, со временем получил фамилию Кунин. О точном месте и времени возникновения фамилии Кунин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Кунин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.