Основой фамилии Купин послужило мирское имя Купа. По одной из них, она образована от нецерковного имени Купа. Согласно другой, менее правдоподобной версии, фамилия Купин восходит к прозвищу Купа из нарицательного «купа» - «груда, куча, ворох, кипа». В таком случае, Купом могли прозвать скупца, жадного человека. Однако не исключено, что такое прозвище дали торговцу. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Купа, со временем получил фамилию Купин.