Фамилия Купинская — это «географическая» фамилия, типичная для жителей западных и южных регионов бывшей Российской империи. Она образована не от личного имени или профессии, а от названия населённого пункта, что сразу отвечает на главный вопрос: предки носителя фамилии, скорее всего, были переселенцами или выходцами из конкретного места.

В основе фамилии лежит название города Купино в Новосибирской области. Село Купино основали в 1886 году переселенцы из центральной России и Украины, а в 1944 году оно получило статус города. Слово «Купино» скорее всего восходит к диалектному «купа» — груда, куча, ворох (например, купа сена). Так могли назвать насыпной холм или место, где собирали стога. Менее вероятна, но возможна связь с растением купальница или с древнерусским «купина» (куст, терновник).

Суффикс -ск- указывает на принадлежность: Купинский буквально означает «из Купина». Такая модель типична для фамилий шляхты и духовенства, но в XIX–XX веках её массово давали крестьянам и мещанам при переписях — просто по месту рождения или выхода. Поэтому Купинские могли быть как крестьянами-переселенцами, так и священниками, получившими фамилию по приходу.

Форма Купинская — женский вариант. Мужская пара — Купинский. Подобные фамилии на -ский/-ская встречаются в польской, украинской, белорусской и русской традициях, но для Сибири, куда людей заселяли по столыпинской реформе, это особенно характерно.

Других версий происхождения у фамилии мало. Если не связывать её с Купином, можно предположить прозвище Купа от того же слова «купа» — коренастый, плотный человек. Но тогда фамилия звучала бы как Купин или Купов, а не Купинский. Поэтому версия с топонимом (названием места) остаётся основной и самой правдоподобной.