Фамилия Купрата — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, сохранив форму именительного падежа. В русской традиции такие фамилии обычно заканчиваются на -ов, -ин или -ский, но Купрата стоит особняком: её основа не получила типичного суффинкса, что выдает либо позднее оформление, либо нерусское происхождение.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Купрат. Его источник — латинское слово «cuprum» (медь). В древнерусском языке через посредничество польского или немецкого бытовало слово «купрат» или «купро» — так могли называть медника, человека, работавшего с медью: литейщика, чеканщика или торговца медной посудой. Медь в средневековой Руси была ходовым металлом для церковной утвари, котлов и монет, поэтому ремесло было заметным и давало прозвище.

Есть и другая гипотеза: Купрата — это форма от греческого имени Киприан (Куприян) через украинское или белорусское произношение. В южнорусских говорах имя Куприян нередко сокращали до Купрат, а потом закрепляли как фамилию. В этом случае Купрата — вариант фамилии Куприянов, но без патронимического суффинкса, что характерно для украинской и белорусской ономастики.

Географически фамилия Купрата встречается в основном на западе России, в Брянской и Смоленской областях, а также в Беларуси. Это подтверждает версию о западнорусском или украинско-белорусском следе. В центральных и северных регионах фамилия практически не фиксируется.

Таким образом, предки носителя фамилии Купрата с наибольшей вероятностью были либо ремесленниками-медниками, либо людьми, чьего отца звали Купрат (разговорная форма Куприяна). Оба варианта ведут к простому сословию — крестьянам или посадским людям, а не к дворянству.