Фамилия Купреянов образована от крестильного имени Киприан (в бытовой русской форме Купреян). Имя восходит к латинскому Cyprianus — «кипрский, с острова Кипр». В православных святцах известен священномученик Киприан, епископ Карфагенский, чьё имя и дало начало множеству производных форм. Ударение в фамилии чаще всего падает на второй слог: Купре́янов, хотя встречаются варианты с ударением на последний слог.

Разберём словообразовательную модель. Основа — Купреян, усечённая народная форма от Киприан. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Купреянов буквально означает «сын Купреяна» или «из рода Купреяна». Такая модель типична для русских фамилий, возникших в среде крестьян и посадских людей в XVI–XVII веках, когда фамилии образовывались от имени отца. Интересно, что фамилия Купреянов встречается реже, чем Купреянов с буквой «и» в корне (Куприянов), хотя обе восходят к одному источнику. Разница в написании — результат местных говоров и неграмотного письма приказных людей: в некоторых регионах «и» переходило в «е» перед «п» (ср. Филипп — Феллипп).

Географически фамилия привязана к центральным и южным губерниям России. По переписям XIX века Купреяновы чаще всего встречались в Тульской, Рязанской, Тамбовской и Воронежской губерниях — то есть в зоне, где были сильны традиции крестьянского именослова. В этих краях имя Купреян было распространённым, и от него легко образовывали фамилию без дополнительных суффиксов. Среди дворянских родов фамилия почти не встречается — это указывает на её простонародное происхождение. Предки носителя фамилии, скорее всего, были крестьянами или однодворцами, а сама фамилия закрепилась в эпоху, когда основная масса населения получила фамилии по отцу.

Стоит упомянуть редкий вариант написания — Купреянов через «ять» в дореволюционных документах (Купреяновъ). Это не ошибка, а отражение церковнославянской традиции, где имя Киприан писалось через «ижицу» и «ять», что в бытовой записи могло давать «е». Сегодня фамилия Купреянов — одна из тех, что сохранила архаичную народную форму имени, не поддавшуюся книжной норме.