Крестильное мужское имя Куприян (Киприан) в переводе с греческого языка означает «житель Кипра». В основу данной фамилии легла производная форма этого имени - Купрюшка. Одним из покровителей имени Киприан считается святой мученик, епископ Киприан Карфагенский. Скорее всего, основатель рода Купрюшкиных был выходцем из простого сословия. Согласно другой версии, фамилия Купрюшкина ведет свое начало от прозвища Купрюшка, которое восходит к нарицательному «купрей» - «дикий бык». Возможно, так называли своенравного человека.