Фамилия Купыро — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия и не географическое название, а, скорее всего, украинское или белорусское прозвище, связанное с характером или внешностью человека.

Корень «купыр» в восточнославянских говорах имеет несколько значений. Самое вероятное — «купырь» или «купыр»: так в украинском и южнорусских диалектах называют растение борщевик или дудник. Прозвище Купыро могли дать высокому, худощавому человеку (по аналогии с высоким стеблем) или тому, кто жил в зарослях этого растения. Вторая версия отсылает к глаголу «купыриться» — капризничать, дуться, быть недовольным. В этом случае прозвище получал обидчивый или своенравный человек.

Фамилия образована по характерной для Украины и Беларуси модели: к основе «Купыр» добавили окончание -о. Такие фамилии (Ткачо, Ковалё, Грицо) типичны для западных регионов Украины, особенно для Волыни, Подолья и Полесья. Окончание -о здесь не указывает на средний род, а является реликтом древней формы обращения или указанием на прозвищное происхождение.

В русском языке фамилия могла адаптироваться через суффикс -ов (Купыров), но вариант Купыро сохранил исходное звучание. Географически фамилия встречается в основном в западной Украине, в меньшей степени — в Беларуси и среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке.

Сословной привязки у фамилии нет: её могли носить и крестьяне, и казаки, и мещане. Прозвище Купыро не несло негативного оттенка и закрепилось как фамилия без изменений, минуя стандартные суффиксы. Это делает её ценной для этимологов: она сохранила живую диалектную форму, почти не тронутую канцелярской унификацией.