Фамилия Курдюк образована от прозвища, которое в южнорусских и украинских говорах давали человеку с заметной особенностью телосложения. В основе лежит слово «курдюк» — жировое отложение у хвоста некоторых пород овец, а в переносном смысле — толстяк или увалень. Прозвище могло быть не обидным, а бытовым, описательным: в крестьянской среде меткие характеристики внешности часто становились семейными именами.

Модель образования проста: суффикс -юк характерен для украинской и западнорусской ономастики. Он указывает на принадлежность или свойство: Курдюк — «сын или потомок Курдюка», либо просто человек, которого так прозвали. Такая модель типична для фамилий, возникших в среде казачества и крестьянства на землях современной Украины, юга России и Беларуси. Встречаются варианты написания — Кордюк, Курдюков, но исходная форма без суффикса -ов сохраняет архаичное звучание.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные образования от прозвищ, связанных с животными и частями тела, отнесены к разряду «прозвищных» фамилий, возникших стихийно, без участия церкви или администрации. Курдюк — не от имени, а от бытового слова, что указывает на низкое социальное происхождение носителей: скорее всего, это были крестьяне или казаки, а не дворяне.

Регионально фамилия чаще всего встречается в Краснодарском крае, Ростовской области, на Украине — там, где разводили курдючных овец. В XIX веке носители фамилии фиксировались в переписях Екатеринославской и Харьковской губерний. Таким образом, предки современного Курдюка — скорее всего, южнорусские или украинские земледельцы и скотоводы, получившие прозвище за плотное телосложение.