Фамилия Курсанин образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей — с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Курсана (в разговорной речи могло звучать как Курсаня). Обычно такие фамилии отвечали на вопрос «чей?»: сын Курсани, человек из семьи Курсани.

Самое вероятное происхождение основы — от слова «курс», но не в значении направления, а в старом, диалектном смысле. В русских говорах «курс» или «курса» могло означать петуха (от звукоподражательного «кур»). Соответственно, Курсаней могли прозвать человека, чем-то напоминавшего петуха: задиристого, голосистого или, наоборот, хвастливого. Такие прозвища по птицам — «Петух», «Кур», «Курсаня» — были типичны для деревенской среды и не несли оскорбления, а скорее закрепляли заметную черту характера или внешности.

Менее распространённая, но возможная версия связывает фамилию с тюркскими корнями. В языках тюркской группы есть слово «курсан» (или близкие формы), означающее «ястреб», «сокол». Если предок носителя фамилии жил в зоне русско-тюркского пограничья (например, на южных рубежах или в Поволжье), прозвище Курсаня могло прийти из татарского или башкирского языков. В этом случае значение — «хищная птица», «ловчий», что также могло указывать на охотника или человека с острым зрением.

Что касается сословной принадлежности, то фамилия Курсанин — крестьянская или мещанская по происхождению. Суффикс -ин в сочетании с прозвищной основой характерен для непривилегированных слоёв населения. В дворянской среде такие фамилии встречаются редко, и если бы предок был из знати, скорее всего, мы бы видели форму Курсанов (с более типичным для дворянских фамилий суффиксом -ов). Поэтому с высокой вероятностью носители фамилии — потомки крестьян, посадских людей или однодворцев, живших в центральных или южных губерниях России.

В написании фамилии нет вариаций — она устойчиво фиксируется как Курсанин. Ударение, судя по типовой модели, падает на второй слог: Курса́нин.