Фамилия Куштова — женская форма фамилии Куштов, и её происхождение напрямую связано с мужским вариантом. Чтобы понять корни, нужно разобрать основу «Кушт-». Здесь мы сталкиваемся с не самой очевидной, но вполне объяснимой этимологией.

Скорее всего, в основе лежит прозвище или мирское имя Кушта. В русских говорах слово «кушта» или «кухта» имело несколько значений. В одних диалектах — это «куст», «заросли», «густая поросль». Человека могли прозвать Куштой за коренастое телосложение, густые волосы или за то, что он жил в лесистой, заросшей местности. В других говорах, особенно северных и сибирских, «кухта» (с вариантом «кушта») — это иней на деревьях, снег, налипший на ветки. Такое прозвище могли дать человеку с седой или очень светлой, «заиндевелой» шевелюрой, либо тому, кто родился или появился в деревне в сильный мороз.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркскими языками, где «куш» — птица, а «кушту» — «птичий». В этом случае прозвище могло указывать на занятие птицеловством или на особую лёгкость, «птичью» походку. Однако для центральной России и севера славянская основа с диалектным «кушта» выглядит убедительнее.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе прозвища Кушта добавился патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность: «чей?» — Куштов, то есть сын Кушты. Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская. Она редкая и встречается преимущественно в северных областях России — в Архангельской, Вологодской областях, а также в Пермском крае, что хорошо согласуется с северным диалектным словом «кухта».

Женская форма Куштова закрепилась в документах как фамилия женщины — дочери или жены человека по фамилии Куштов. Никаких особых дворянских родов или знаменитых исторических личностей с этой фамилией не зафиксировано, что типично для прозвищных фамилий, возникших в среде простых людей.