Фамилия Куштысева — редкий случай, когда этимология почти не вызывает споров, но ведёт в две разные стороны. Первая версия, самая надёжная, отсылает к коми-пермяцкому слову «куштысь» — тетерев. В тех же говорах зафиксировано и «куштысевка» — куропатка. Если основатель рода получил прозвище Куштысь, он почти наверняка был охотником на боровую дичь. Для коми-пермяцкой среды, где лесной промысел веками кормил семьи, такое прозвище — прямое указание на занятие, а не на случайную черту.

Вторая версия тянет прозвище к русскому диалектному «куштан» — мотыга, кайло, кирка землекопа. Здесь Куштысь могло означать не птицу, а орудие труда, а затем и самого работника. Тогда родоначальник — профессиональный землекоп, крестьянин или наёмный рабочий, который брался за тяжёлые земляные работы. Эта версия слабее: переход от «куштан» к «куштысь» неочевиден, а коми-пермяцкое происхождение подтверждается и географией фамилии, и живым словом в языке.

Суффикс -ев в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Куштысев, то есть сын или потомок Куштыся. Форма Куштысева — женский или родительный падеж, но в быту закрепилась как фамилия в женском роде. Модель образования типична для русских фамилий, адаптированных из финно-угорской основы.

Географически фамилия тяготеет к Пермскому краю и Республике Коми, что дополнительно подтверждает первую версию. Встречаемость низкая, фамилия не перешла в разряд массовых, и это делает её ценной для локальной ономастики — она сохранила прямую связь с промыслом или орудием, а не растворилась в безликом списке.