Фамилия Кустаркин происходит от прозвища или профессии, а точнее — от слова «кустарь». В дореволюционной России кустарями называли ремесленников, работавших на дому, без найма на фабрику или в мастерскую: сапожников, бондарей, прядильщиков, скорняков. Носитель фамилии — потомок человека, который занимался таким надомным промыслом. Модель образования простая: основа «кустарь» плюс суффикс принадлежности -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность к отцу («чей сын?» — Кустаркин). То есть Кустаркин буквально означает «сын кустаря».

Интересно, что фамилия эта довольно редкая и встречается в основном в центральных и северных губерниях России — в тех регионах, где было развито кустарное производство: в Тверской, Ярославской, Владимирской, Нижегородской губерниях. В XIX веке кустарный промысел кормил целые деревни, и прозвище Кустарь мог получить не только сам ремесленник, но и его дети, если семья была известна своим ремеслом.

Есть у фамилии и вторая, менее очевидная версия происхождения. Слово «кустарь» в некоторых говорах имело переносное значение — «ловкий, умелый человек», иногда с оттенком хитрецы или изворотливости. В этом случае прозвище могло закрепиться за человеком не по профессии, а по характеру. Однако первая версия — профессиональная — более обоснована и подтверждается типичной для русских фамилий моделью образования от названий занятий.

С точки зрения словообразования, фамилия Кустаркин стоит в ряду таких же «профессиональных» фамилий на -ин, как Плотникин, Кожевникин, Столяров (хотя Столяров — на -ов, по другой модели). Встречается и вариант без суффикса — Кустарев, но он менее распространён. Кустаркин звучит архаичнее, как раз за счёт суффикса -ин, который чаще использовался в северных и центральных говорах.

Известных носителей фамилии в истории немного, и это объяснимо: фамилия недворянская, крестьянская или мещанская, и в дореволюционных справочниках она почти не фиксируется. Но именно такие фамилии — живые свидетели повседневного труда и ремесла, из которых складывалась экономика российской глубинки.