Фамилия Кустарова образована от прозвища или профессии Кустарь. В основе лежит слово «кустарь» — ремесленник, работающий на дому, вручную, без использования сложных машин и фабричного производства. В XIX веке кустари составляли значительную часть экономики: ткачи, сапожники, бондари, гончары, резчики по дереву. Прозвище Кустарь мог получить человек, занимавшийся таким ремеслом, либо — реже — тот, кто жил в кустах, в лесной или заросшей местности, но эта версия менее вероятна.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: Кустарова — дочь или жена Кустаря. Форма на -ова типична для русских фамилий, закрепившихся в женском роде от отчества или прозвища мужчины. В документах фамилия встречается в центральных и южных губерниях России, особенно в Тамбовской, Рязанской и Воронежской областях, где кустарные промыслы были развиты исторически.

Интересная деталь: фамилия Кустаров (и её женский вариант) нередко фиксируется в старообрядческой среде. Кустари-староверы часто избегали фабрик, предпочитая домашнее производство, поэтому прозвище могло закрепиться именно в таких общинах. Сравните с однокоренными фамилиями: Кустарёв, Кустарников — последняя образована от растения, а не от профессии. Ударение в фамилии Кустарова падает на второй слог — Кустáрова, хотя в некоторых говорах возможно смещение на последний.

Ономастических споров вокруг фамилии почти нет: значение прозрачное, корень живой, и даже в советское время слово «кустарь» не ушло из быта, обозначая надомного мастера. Так что носитель фамилии с большой вероятностью происходит от вольного ремесленника, а не от крепостного крестьянина.