Фамилия Кутафин образована от прозвища Кутафа, в основе которого лежит аналогичное нарицательное, имеющее значение «неуклюжая, несобранная, неповоротливая женщина». Вероятно, таким прозвищем нарекли рассеянную, суетливую, либо очень полную женщину. Таким образом, прозвище может указывать на особенности характера или внешности родоначальницы Кутафиных. Согласно другой версии, в основе фамилии лежит не прозвище, а мирское имя Кутафа, которое выполняло охранительную функцию. В данном случае, надеясь иметь трудолюбивую, ловкую и умелую девочку, родители прозвали ее Кутафой. Так и прозвище Кутафа закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Кутафин.