Фамилия Кутербеков — редкий случай в русском ономастиконе, где тюркская основа соединилась с русским патронимическим суффиксом. По модели образования она типична для фамилий, возникших у поволжских татар, башкир или казахов, перешедших в русскую среду: к основе на согласный прибавили суффикс -ов (упрощённая форма от -ев), указывающий на принадлежность к роду. В отличие от фамилий на -ин, которые образуются от основ на -а/-я, здесь работает мужской тип склонения.

Корень «Кутербек» — составное имя. Первая часть «кутер» восходит к тюркскому «күтәр» (поднимать, возвышать) или к диалектному «кутерьма» — суета, беспорядок. Но в антропонимике правдоподобнее видеть здесь компонент «күтәр» в значении «поддерживающий, возвышающий». Вторая часть «бек» (бег, бий) — древний титул знати, «господин», «князь». Имя Кутербек, таким образом, могло означать «возвышенный господин» или «поднимающий (свой) род». Подобные двухосновные имена (Айбек, Темирбек, Кутербек) были распространены у тюркских народов и часто давались с пожеланием знатности и силы.

Географически фамилия Кутербеков тяготеет к регионам с компактным проживанием татар и башкир: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская области. Встречается она и у казахов, но там фамилия обычно оформляется как Кутербеков или Кутербек (без русского суффикса). В русских переписных книгах XVI–XVII веков подобные фамилии не фиксировались — они появились позже, в XIX веке, когда при переходе в православие или при записи в метрические книги тюркские имена получали русские окончания.

Социальный статус первых носителей — скорее всего, служилые татары, торговцы или зажиточные крестьяне. Титул «бек» в имени указывает на уважаемое происхождение, но к моменту формирования фамилий в XIX веке он уже давно утратил административный вес и стал просто частью личного имени. Никакой связи с княжеским титулом в русском понимании здесь нет.

Однокоренных фамилий немного: Кутербеков, Кутербеев (с заменой -бек на -бий), а также упрощённые формы вроде Кутербаев. Вариант с «е» в первом слоге (Кутербеков) — самый распространённый, но встречается и написание Кутырбеков, что отражает диалектное произношение.