Фамилия Кутергин — одна из тех, что хранят в себе живое народное слово. В её основе лежит прозвище Кутерга, а корень уходит в диалекты: в тверских и вологодских говорах «кутерга» означала «кутерьма». Человека, которого так называли, скорее всего, описывали как суетливого, беспокойного, вечно суматошного. Часто такое прозвище прилипало к тому, кто любил спорить и ругаться по любому поводу.

Но у слова «кутерга» было и другое, более образное значение — «вьюга, метель». Поэтому не исключено, что прозвище Кутерга давали не за характер, а по обстоятельствам рождения: так родители могли назвать ребёнка, появившегося на свет в сильную непогоду.

Фамилия образовалась по стандартной русской модели — с помощью патронимического суффикса -ин, который указывает на принадлежность: Кутергин значит «сын Кутерги». Эта модель характерна для фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а, -я.

Интересно, что фамилия не получила широкого распространения за пределами северных и сибирских регионов. В Книге памяти Алтайского края, например, упоминается служащий базы УНКВД Кутергин Александр Назарович, родившийся в 1898 году в Томской губернии. Эта запись — не просто факт биографии, а косвенное подтверждение того, что фамилия бытовала именно в сибирской среде, куда её принесли переселенцы из северных губерний.