Фамилия Кутермина образована от прозвища или мирского имени Кутерма. В её основе лежит татарское слово «кутерма» — «суета, сумятица, хлопоты, суматоха; беспорядок; крик, брань, ссора». Скорее всего, прозвище Кутерма дали человеку хлопотливому, взбалмошному или неуживчивому. Однако у слова есть и другое значение — «непогодь, вьюга, метель». В этом случае Кутерма могло быть не прозвищем, а мирским именем, которое родители давали ребёнку, родившемуся в ненастье, или с пожеланием-оберегом: чтобы ребёнок вырос таким же сильным и неудержимым, как буран.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Кутермин, то есть «сын Кутермы». Такая модель характерна для фамилий, возникших в среде служилых людей и крестьян северных и центральных губерний России. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образуются от основ на согласный, -ин присоединяется к основам на -а/-я, что и произошло с именем Кутерма.

Географически фамилия Кутермина (и мужской вариант Кутермин) встречается в Поволжье и на Урале — регионах, где веками соседствовали русские и татарские говоры. Это объясняет тюркский корень прозвища: слово «кутерма» прочно вошло в местные диалекты. Встречаются и однокоренные фамилии — Кутермины, Кутерма, Кутерманов, но именно форма с суффиксом -ин стала основной и закрепилась в документах.

Так что потомок человека, которого звали Кутерма, со временем получил фамилию Кутермин. В ней сохранилась память либо о характере предка — суетливого или сварливого, либо о природном явлении, с которым совпало его рождение.