Фамилия Кужашев — редкая и территориально привязанная. Её основа — тюркское мужское имя Кужаш (Кужаш). В башкирском и татарском языках имя Кужаш (Кужаш, Кужәш) — это, скорее всего, вариант имени Ходжаш, восходящего к арабскому «ходжа» (господин, хозяин, учитель). Имя было популярно у башкир и татар, и от него образовали фамилию по стандартной для этих народов модели: к основе добавили русский патронимический суффикс -ев (указывает на принадлежность: «сын Кужаша»).

Прозвищная версия тоже существует, но менее вероятна. В башкирском языке есть слово «куж» (күж) — «болото, топь», и «кужа» (күжә) — «болотный, низменный». Если бы фамилия образовалась от прозвища по месту жительства, мы бы увидели форму Кужев или Кужин, а не Кужашев. Суффикс -аш в тюркских именах часто выступает как ласкательный или уменьшительный формант, что подтверждает происхождение именно от личного имени, а не от нарицательного слова.

География фамилии узкая. Основной ареал — юг Башкортостана и прилегающие районы Оренбургской области. Встречается она и у башкир, и у татар-мишарей, что неудивительно: имя Кужаш бытовало в обеих средах. Фамилия не входила в число дворянских, не фиксируется в старых родословных книгах — её носители, вероятнее всего, были рядовыми общинниками, тептярями или государственными крестьянами, которые получили фамилию при переписях XIX века.

Интересная деталь: в дореволюционных записях фамилию могли записать как Кужашевъ, Кужашов, а иногда и Кужашев (с мягким знаком на конце — след арабского написания через хамзу). В современных базах данных встречаются единичные носители в Казахстане и Узбекистане — потомки тех, кто уехал в Среднюю Азию в советское время. Таким образом, Кужашев — прямая отсылка к имени предка, которого звали «господином» или «учителем», хотя сам он, скорее всего, был простым крестьянином или скотоводом.