Фамилия Кужеев — один из тех случаев, когда угадать происхождение с первого взгляда сложно: слишком разные языки могли дать ей начало. Самая очевидная версия ведёт к польскому слову kurz — «пыль». Прозвище Кужея могли дать человеку, чей дом стоял у пыльной большой дороги, или же не самому чистоплотному соседу. Тут работает та же логика, что и в русских фамилиях Пылин или Пыльнев.

Но есть и другая славянская ветвь — чешское kuže означает «кожа». В этом случае Кужеей называли скорняка, мастера по выделке кож. Ремесленные прозвища часто ложились в основу фамилий без изменений, и суффикс -ев здесь выполняет стандартную роль: «сын Кужеи».

Третья версия уводит в тюркские языки. Словом «кужея» в некоторых говорах называли болотистую низину с лиственным лесом. Для человека, жившего в такой местности, прозвище было бы естественным топографическим указателем — как, скажем, Заболоцкий или Поддубный.

Какая из гипотез правдоподобнее? Точного ответа нет, но обратим внимание на суффикс. Фамилия оформлена по русской модели на -ев, что говорит об адаптации иноязычной основы в славянской среде. Если бы корни были чисто русскими, мы бы скорее ждали форму Кужеев от прозвища Кужа (с другим значением), но здесь основа именно «Кужея». Это склоняет к тому, что исходное слово было заимствованным, а фамилия закрепилась на стыке культур — возможно, в зонах контакта славянского и тюркского населения.