Фамилия Кужев — один из тех случаев, когда за простым звучанием скрывается как минимум две возможные истории происхождения, и обе ведут на Кавказ. Самая прямая версия связывает фамилию с адыгским словом «куж» — «груша». В традиционной культуре имя, образованное от названия плодового дерева, могло выполнять роль оберега: родители надеялись, что природа примет ребёнка как своего и передаст ему силу и плодородие растения. По этой модели появилось имя Куж, а от него — фамилия Кужев, то есть «потомок Кужа».

Вторая версия отсылает к лезгинскому имени Къужа — местному варианту имени Хожа (из персидского «хожа» — «господин, хозяин»). В этом случае фамилия Кужев означает «принадлежащий Къуже» и указывает на уважаемого предка-хозяина или наставника. Обе гипотезы не противоречат друг другу: фамилия могла возникнуть независимо в разных кавказских языковых средах — адыгской и лезгинской.

Сама модель образования — через суффикс -ев — типична для русских фамилий, но здесь она наложилась на иноязычную основу. В документах фамилия встречается в Кабардино-Балкарии: Книга памяти республики упоминает Бубу Катовича Кужева (1872 года рождения, село Псыхурей) и Мачраила Каровича Кужева (1891 года рождения, село Вольный Аул). Эти записи подтверждают, что фамилия бытовала в адыгской среде, что делает версию с «грушей» более географически обоснованной, хотя лезгинский след полностью исключать не стоит.