Фамилия Лаапынин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В основе, скорее всего, лежит прозвище Лапын, которое, в свою очередь, связывают со словом «лапа». В старину «лапами» в просторечии называли большие, сильные руки. Человека с такой особенностью и могли прозвать Лапыном. Рука в народном сознании — символ власти и подчинения: отсюда и «правая рука» (главный помощник), и «держать в руках» (властвовать). Считалось также, что рука бывает «тяжёлой» или «лёгкой»: если человек с лёгкой рукой посадит дерево, оно примется, а с тяжёлой — засохнет. Так что прозвище могло указывать не только на физическую силу, но и на характер — властный или «тяжёлый» для окружающих.

Однако есть и другие версии, и это делает фамилию особенно интересной. По одной из них, прозвище Лапын восходит к мансийскому слову «лапын» — «поднимающийся». В таком случае основатель рода мог быть человеком духовно или физически сильным, «поднимающимся» над другими. По другой версии, корни фамилии стоит искать в эстонском языке: слово «lääpas» переводится как «разношенный, растоптанный». Тогда Лапыном могли называть небогатого человека, который донашивал старую одежду и обувь.

С точки зрения словообразования, фамилия образована с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: Лаапынин — это «сын Лапына» или «из семьи Лапына». Двойное «а» в начале — редкая особенность, которая могла возникнуть из-за особенностей местного произношения или при записи фамилии в документах. Встречается и упрощённый вариант — Лапынин. Какая из версий верна — сказать сложно, но первая, «ручная», выглядит наиболее естественной для русской прозвищной традиции.