Фамилия Лабынцев — наглядный пример того, как прозвище, данное одному человеку, закрепилось за его потомками в виде родового имени. В основе фамилии лежит прозвище Лабынец. Оно, в свою очередь, образовано от белорусского слова «лабан», которое имеет несколько значений. В прямом смысле «лабан» — это «лобач», человек с большим лбом или крупной головой. Однако в старину так называли не только по внешнему признаку. Лобаном (а также лабаном, лобуном или лобачом) могли прозвать крепкого, крупного человека. Но ещё чаще это прозвище давали тому, кто отличался смекалкой, догадливостью или обладал большими знаниями — «большелобый» в народном сознании ассоциировался с умом.

От прозвища Лабан (или Лабын) с помощью уменьшительного суффикса -ец образовали именование Лабынец. Так могли назвать сына человека по прозвищу Лабан, то есть «маленького Лабана». В славянской традиции это типичная модель: сначала прозвище отца переходило на сына в несколько изменённой форме, а затем, с добавлением патронимического суффикса -ев, закреплялось за всей семьёй. Таким образом, Лабынцев — это потомок Лабынца, а тот, в свою очередь, сын Лабана.

Фамилия редкая, что указывает на её локальное происхождение. Наиболее вероятная географическая привязка — юго-западные регионы, где было распространено белорусское влияние: Смоленщина, Брянщина или пограничные с Беларусью земли. Встречаются варианты написания Лабынцов и Лабынцев, но последний закрепился как нормативный. В отличие от более частых фамилий на -ов, образованных от прозвищ на согласный, здесь сработала двухступенчатая модель: прозвище — отчество с суффиксом -ец — фамилия с суффиксом -ев. Это делает словообразовательную цепочку Лабынцев нестандартной и более древней, чем у фамилий, образованных напрямую от прозвища.