Фамилия Лагина — женская форма, а её мужской вариант — Лагин. В основе фамилии, скорее всего, лежит некалендарное имя или прозвище Лага. В русских говорах «лагой» называли нерасторопного, вялого человека, а также того, кто любит полежать, ленится. В словаре Даля «лага» — это «лентяй, лежебок». Прозвище могло закрепиться за человеком с таким характером или за тем, кто медлителен от природы.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от слова «лаг» в значении «низина, болотистое место». В таком случае прозвище Лага получал житель низины или сырой местности, а фамилия стала бы топонимической по месту жительства. Однако эта версия слабее, потому что прозвища по характеру встречаются в основе русских фамилий гораздо чаще, чем топографические.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Лагин — «сын Лаги» или «человек из семьи Лаги». Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я. Сравните с однокоренными фамилиями: Лагин, Лагутин, Лаговский. Первые две образованы от одной основы, но разными суффиксами, а последняя — через прилагательное, часто указывающее на местность.

Фамилия Лагин известна по литературному псевдониму советского писателя Иосифа Лагина (настоящее имя — Иосиф Рабинович), автора повести «Старик Хоттабыч». В его случае псевдоним был, по всей видимости, образован от фамилии матери или выбран по созвучию с фамилией писателя Лагина. Для остальных носителей фамилия, скорее всего, имеет прямое отношение к прозвищу предка-лежебоки.

Встречаемость фамилии невысокая, она сосредоточена в центральных и южных регионах России, где прозвище Лага было в ходу. Как и многие фамилии на -ин, она не указывает на дворянское или крестьянское происхождение — её могли носить представители любого сословия, если у них был предок с таким прозвищем.