Фамилия Лагинская — редкий пример, где географическое происхождение почти наверняка перевешивает прозвищное. В отличие от большинства русских фамилий на -ский, которые могли даваться по поместью или месту службы, эта фамилия, скорее всего, указывает на выходца из конкретного топонима. Основа «Лагин-» без труда связывается с названиями вроде Лагино, Лагинск или Лага. Такие пункты есть в нескольких регионах: например, деревня Лагино в бывшей Псковской губернии или село Лаги (ныне Львовская область Украины). Приставка «-ская» в женском роде (или «-ский» в мужском) в XIX веке часто закреплялась за переселенцами, которые называли себя по покинутой малой родине: «он из Лагина» — «Лагинский».

Само название поселения Лагино, в свою очередь, восходит к нецерковному личному имени или прозвищу Лага. В русских говорах «лага» — диалектное слово с разными значениями: от «лежебока» (от глагола «лагать» — ложиться) до «низина, ложбина» (родственное «лог»). В ономастике известна фамилия Лагин (от того же корня), а Лагинская — её патронимический или топонимический вариант. Менее вероятна, но возможна связь с тюркским «лагын» — «сокол», однако для северо-западных русских земель, где фамилия встречается чаще, это экзотично.

Словообразовательная модель типична для дворянских и разночинных фамилий второй половины XVIII — XIX века. В отличие от крестьянских фамилий на -ов/-ев или -ин, которые образовывались от имени отца, «-ский» часто маркировал либо владельческий статус (помещик Лагинский — владелец деревни Лагино), либо искусственное происхождение — такую фамилию могли дать в семинарии или канцелярии при переселении. Однако в случае Лагинской второй вариант маловероятен: семинаристы обычно брали фамилии от церковных праздников или латинских основ, а не от реальных деревень.

Написание фамилии устойчивое, с окончанием -ая, что характерно для женского рода прилагательных. Встречается и мужской вариант Лагинский, но в бытовом употреблении форма Лагинская может принадлежать и женщине, и целому роду, если фамилия закрепилась в женском роде исторически (как, например, у некоторых старых московских или петербургских семей). Поскольку фамилия редкая, её носители, скорее всего, происходят из одного или двух родов, разошедшихся по стране из Псковской или Смоленской губернии.

Если сравнивать с однокоренными, то Лагинская стоит особняком от более частых Лагиных и Лаговских. Лагины — прямая патронимическая фамилия («сын Лаги»), а Лаговские — топонимическая, но от села Лагово. Лагинская же сохраняет более прозрачную привязку к месту, что делает её ценной для генеалогического поиска: искать предков стоит в писцовых книгах северо-запада России, где упоминаются деревни с корнем «лаг-».