Фамилия Лагутин, при взгляде со стороны, кажется простой и прозрачной. Однако за ней скрывается не одна, а как минимум две версии происхождения, и выбор между ними — хороший повод разобраться в истории языка. Самая надежная и часто цитируемая в ономастических словарях версия связывает фамилию с крестильным именем. Основой послужило мирское имя Логута, которое является производной, уменьшительной формой от полных имен Лонгин или Логгин. Чередование гласных О/А в корне (Логута → Лагута) — явление, типичное для южнорусских и белорусских говоров, где господствует «акающее» произношение: в безударной позиции звук [о] переходит в [а]. Так имя Логута на письме и в быту превратилось в Лагуту, а фамилия потомков, соответственно, получила суффикс принадлежности -ин: Лагутин — «сын Лагуты».

Существует и альтернативное объяснение, но оно гораздо менее правдоподобно. Согласно ему, в основе лежит не имя, а прозвище Лагун. В южных говорах «лагун» или «лагунок» — это деревянная кадка, бочонок для воды или меда. Переносное значение такого прозвища могли дать полному, невысокому человеку, чья фигура отдаленно напоминала округлый бочонок. Однако эта версия уступает первой по нескольким причинам. Во-первых, суффикс -ин в фамилии Лагутин прямо указывает на имя собственное (Лагута), а не на нарицательное существительное (для прозвища Лагун была бы более характерна форма Лагунов). Во-вторых, фамилии от производных форм крестильных имен — явление массовое и типичное для русского ономастикона, в то время как прозвищные фамилии от названий утвари встречаются реже.

Таким образом, с высокой долей вероятности предок носителя фамилии Лагутин был человеком, которого в быту звали уменьшительно-ласкательно Логутой или Лагутой. Это имя, в свою очередь, восходит к римскому родовому имени Longinus (Лонгин), которое в христианской традиции ассоциировалось с сотником Лонгином, пронзившим копьем ребро распятого Христа. Фамилия Лагутин органично вписывается в широкий ряд русских фамилий на -ин, образованных от обиходных форм канонических имен: от Михаила — Мишутин, от Павла — Пашутин, от Лонгина — Лагутин.