Фамилия Лахтунов — яркий пример того, как местное диалектное слово становится основой для родового имени. Её ядро — «лахта́», слово, которое в северных и сибирских говорах означает залив, мелководную бухту, губку или даже болотистую низину. Человек, живший у такого водоёма, получал прозвище Лахтун — «житель у лахты». Суффикс -ун здесь не случаен: он активно работал в русской ономастике, образуя прозвища по характерному признаку или действию (ср. Болтун, Молчун, Говорун). Лахтун — не просто «тот, кто у лахты», а скорее «человек, для которого лахта — родное место».

Слово «лахта» — древнего финно-угорского происхождения, из прибалтийско-финских языков (ср. фин. lahti — «залив»). Это не случайно: фамилия географически привязана к Русскому Северу, Карелии и побережью Финского залива. Топонимов с корнем «лахта» в этих краях множество: деревни Лахта, Лахтинский, сам финский залив когда-то называли Лахтинским морем. Соответственно, основная масса Лахтунов — выходцы из этих мест, потомки поморов или крестьян, селившихся по берегам озёр и морских губ.

Модель образования проста: прозвище Лахтун + патронимический суффикс -ов, дающий значение «сын Лахтуна», «принадлежащий роду Лахтунов». Это типичная русская фамилия второй волны, когда прозвища, а не крестильные имена, становились основой для родовых имён. В отличие, скажем, от фамилии Лахтин (от той же «лахты», но через более книжную форму), Лахтунов сохраняет живую, разговорную огласовку — с характерным для северных говоров суффиксом.

Встречаются и более редкие варианты написания — Лахтонов, где корень не редуцировался. Но основная масса носителей — именно Лахтуновы. Фамилия не относится к числу аристократических или боярских: её носители — в основном крестьяне и мещане из северных губерний. Встречается она нечасто, но устойчиво — в Архангельской, Вологодской, Ленинградской областях, а также в Сибири, куда северян переселяли в ходе аграрных реформ. Если вы Лахтунов, ваши предки почти наверняка жили у воды — на берегу залива, озера или в низине у болота, и местные прозвали их по этому признаку.