Фамилия Лапушкина — женская форма, а её основа уходит в мужское прозвище или семейное имя Лапушка. В русской ономастике суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Лапушкин, то есть сын, внук или человек из рода Лапушки. Это типичная модель для фамилий, образованных от прозвищ с окончанием на -а, -я.

Вероятнее всего, прозвище Лапуша или Лапушка носило ласковый характер. Так в крестьянской среде могли обращаться к любимой дочери, младшему ребёнку или к человеку, которого хотели приласкать. В этом случае фамилия отражает не внешность или профессию, а семейное отношение — ласковое прозвище закрепилось за родом.

Есть и другая, более предметная версия: Лапушка — это народное название лопуха. В говорах лопух нередко называли «лапушником» или «лапушком». Отсюда прозвище мог получить человек с большими, оттопыренными ушами — лопоухий. Либо же прозвище давали простодушному, наивному человеку, которого сравнивали с этим растением по его бесхитростности.

Третья, менее очевидная, но документально подкреплённая версия, отсылает к глаголу «лапушить». В тверских и псковских говорах это слово означало «бодриться, упрямиться, сопротивляться». Если прозвище пошло от этого корня, то Лапушкой называли человека строптивого, упрямого, с характером.

Таким образом, фамилия Лапушкина могла возникнуть в разных регионах и по разным причинам: как ласковое домашнее имя, как прозвище по внешнему сходству с лопухом или как характеристика упрямца. Все три версии имеют под собой реальную языковую почву, и какая из них верна для конкретной семьи — зависит от местных говоров и семейных преданий.