Фамилия Латышко — редкий случай, когда этноним (название народа) стал основой не для очевидной фамилии вроде Латышев, а для формы с уменьшительно-ласкательным суффиксом. Если Латышев прямо указывает на предка-латыша («чей сын?» — Латышев), то Латышко — это прозвище, которое дали человеку, похожему на латыша, или тому, кто имел с ними дело, но с оттенком «маленький латыш» или «латышок».

Ключ к фамилии — суффикс -к-о. В украинской, белорусской и южнорусской традиции этот суффикс часто превращал прозвище в фамилию без дополнительных патронимических окончаний (как -ов/-ев). Сравните: Козак → Козачко, Грек → Гречко, Цыган → Цыганко. Латышко — это не «сын Латыша», а сам человек, которого в селе прозвали Латышком: возможно, за светлые волосы, говор с «оканьем» или за то, что он торговал льном из Прибалтики.

Географически фамилия тяготеет к западным и южным регионам бывшей Российской империи — Черниговщине, Полтавщине, Гродненщине. В дореволюционных переписях Латышко встречается среди крестьян и мещан, что логично: прозвища по национальности в деревне давали без злого умысла, просто для отличия. Интересно, что в XIX веке в Витебской губернии фиксировали двойные написания — Латышко и Латышков, что показывает колебание между украинско-белорусской моделью и обрусевшим вариантом.

Есть и более редкая версия — от личного имени Латыш, которое могло быть не этнонимом, а производным от крестильного имени Галактион (в просторечии — Латыш). Но она спорная: прямых документальных подтверждений такой трансформации в ономастике нет, и большинство исследователей (вслед за Б. Унбегауном) склоняются к этнической основе.

В любом случае, фамилия Латышко — не про «латышскую кровь» в современном понимании, а про то, как в многокультурной среде XIX века сосед давал соседу меткое прозвище, которое закрепилось в документах. Сегодня она встречается и в России, и на Украине, и в Беларуси, но её носители почти наверняка не знают о той старой деревенской шутке или торговой истории, что дала им фамилию.