Фамилия Лексункина — наглядный пример того, как церковное имя превращалось в бытовое прозвище, а затем закреплялось в качестве родового. В её основе лежит просторечная, «домашняя» форма имени — Лексунка. Это производное от одного из двух самых распространённых на Руси христианских имён: Алексей (с греческого — «заступник») или Александр («защитник»). Оба имени относились к церковным, и в народе их часто сокращали до единой основы Лекс-: отсюда и фамилии Лексин, Лексиков, Лексанов, а также Лексункина.

Суффикс -к- в слове Лексунка указывает на уменьшительно-ласкательную или обиходную форму. Мужской вариант фамилии — Лексункин, а женский — Лексункина. По модели образования это типичная «патронимическая» фамилия, то есть отвечающая на вопрос «чей?»: буквально — «дочь (или жена) Лексунки». Скорее всего, человек, давший начало роду, был выходцем из рабочей или крестьянской среды: именно в этих слоях населения уменьшительные имена на -ка (вроде Ивашка, Петрушка, Лексунка) были особенно распространены и не считались фамильярными, а использовались как повседневные.

Интересно, что, в отличие от фамилий на -ов/-ев, которые могли указывать на принадлежность к отцу (Иванов — сын Ивана), фамилия Лексункина сохранила именно обиходно-ласковую форму, что реже встречается в документах дворянских родов. Таким образом, потомок человека по прозвищу Лексунка со временем получил фамилию Лексункина, и она закрепилась за его семьёй.