Фамилия Лексункин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Лексункин послужило церковное имя Алексей. Фамилия Лексункин восходит к просторечной форме имени Алексей (или Александр), которая звучала как Лексунка. Имена Алексей (в переводе с греческого «заступник, помощник») и Александр («защитник», «мужественный») очень распространены у русских, а потому в России часто встречаются фамилии с вариантами основы Лекс-: Лексин, Лексиков, Лексункин, Лексанов, Лексин и др. Оба указанных имени относятся к церковным, так как в истории христианства было множество подвижников, носивших имя Алексей и Александр. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Лексунка, со временем получил фамилию Лексункин. О точном месте и времени возникновения фамилии Лексункин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Лексункин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.