Фамилия Лифин — редкий случай, когда географическая привязка оказывается едва ли не важнее, чем разбор корня. Если отбросить очевидное, но маловероятное сближение с греческим именем Филя (Филипп) через промежуточную форму Лифа, то основная версия ведет в Белоруссию и на западные окраины России.

В основе фамилии лежит прозвище Лифя или Лифа. В белорусских и смоленских говорах «ліф» или «ліфа» — это заливной луг, пойма, низкое сырое место у реки. Человек, живший на таком лугу или владевший им, получал прозвище Лифа. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Лифин, то есть сын Лифы, потомок Лифы. Модель образования простая и прозрачная, типичная для восточнославянских фамилий XVI–XVII веков.

Менее распространенная, но тоже возможная версия связывает фамилию с литовским или латышским корнем «līv-» (лив, ливский), что отсылает к историческому народу ливов, населявшему побережье Балтики. В этом случае Лифин мог означать «потомок лива» или «выходец из Ливонии». Однако для этой гипотезы нет надежных диалектных подтверждений в русском именослове, а вот топонимическая версия с «лифой»-лугом подтверждается документами по Смоленщине и Витебщине.

Фамилия не получила широкого распространения, не стала дворянской и не попала в массовые списки крестьян после отмены крепостного права. Она осталась локальной, что только подтверждает ее происхождение от конкретного географического или бытового прозвища. Носители фамилии Лифин — это скорее всего потомки крестьян или однодворцев из западных губерний, где слово «лифа» было в ходу.