Фамилия Лигацкая — женская форма фамилии Лигацкий, и её происхождение не лежит на поверхности. Сразу бросается в глаза редкий суффикс -ацк-/-яцк-, который встречается в русских фамилиях гораздо реже, чем привычные -ов или -ин. Этот суффикс часто указывает на западнорусское или польское влияние: в Речи Посполитой такие окончания были типичны для шляхетских фамилий, образованных от названий местностей (типа Островецкий, Барановицкий). Следовательно, основа фамилии — «Лигац» — почти наверняка происходит от топонима: села, местечка или усадьбы с названием Лигацы, Лигацк или Лигачево. Такие пункты могли существовать на территории современной Беларуси, Украины или восточной Польши.

Что означало исходное название? Самое правдоподобное объяснение — от литовского или балтского корня «lig-», который в древнепрусском и литовском языках связан с понятием «болото», «топь», «вязкая грязь». В литовском языке есть слово «lygas» — «ровный», но в топонимике балтов «lig-» чаще давало названия болотистым низинам. Таким образом, предок-носитель фамилии Лигацкий мог быть выходцем из поселения, стоявшего на болотистой местности, или же владельцем такого имения. Альтернативная, но менее убедительная версия — связь с польским «ligać» (лягаться, брыкаться), откуда могло возникнуть прозвище для драчливого или своенравного человека, но для фамилии на -ский топонимическое происхождение надёжнее.

Социальный контекст тоже показателен. Фамилии на -ский в Российской империи до XIX века были в основном дворянскими или духовными. Если Лигацкие — потомки шляхты, то их предки могли владеть землёй в тех самых Лигацах. Если же фамилия попала в среду крестьян или мещан, то, скорее всего, её носители получили её уже после отмены крепостного права, когда бывшим крепостным нередко давали фамилии по названиям их бывших имений или по местности, где они жили.

Географически фамилия Лигацкая сегодня встречается редко, но её следы можно найти в западных областях России, а также в Беларуси и на Украине. Встречается и вариант написания через «е» — Легацкая, что могло возникнуть из-за акающего произношения или ошибок переписчиков.