Фамилия Лилицкий — редкий случай, когда в основе лежит не имя или ремесло, а название цветка. Исходное слово — «лилия». Но если бы фамилию давали по простой аналогии с «розой», мы бы получили Лилиев или Лилин. Вместо этого — суффикс -цк-, типичный для польской шляхты и украинской старшины, а также для русских фамилий, образованных от географических названий.

Самый вероятный путь появления фамилии — от названия населённого пункта вроде Лилице, Лилицк или Лилицы. Такие топонимы могли возникнуть от прозвища помещика или от названия усадьбы, украшенной лилиями. В этом случае Лилицкий — не «сын лилии», а «тот, кто родом из Лилиц». Вторая версия — семинарская. В духовных училищах XVIII–XIX веков будущим священникам нередко давали «цветочные» фамилии: Розов, Фиалкин, Лилин. Вариант Лилицкий мог появиться как облагороженная форма — с суффиксом, придающим фамилии «благородное» звучание в польском или малороссийском вкусе. Символика лилии в христианстве (чистота, непорочность) поддерживает эту гипотезу: такую фамилию мог получить семинарист с безупречной репутацией.

Формы Лилицкий и Лилицкая — это не разные фамилии, а грамматические варианты по роду. Встречается и написание с одной «л» — Лилицкий, хотя этимологически вернее двойное «л» (от латинского lilium). В России фамилия редкая, встречается в основном на западе страны — в Беларуси, на Украине и в западных областях России, что тоже указывает на польское или западнорусское происхождение модели. Точное время и место возникновения конкретного рода Лилицких можно установить только по архивным записям — метрическим книгам и ревизским сказкам.