Фамилия Липаков образована от прозвища Липак. Оно ведет свое начало от аналогичного украинского нарицательного со значением «рабочий, который обмазывает глиной стены». Кроме того, в украинском языке слово липак употребляется также в значении «пирог». Поэтому предок носителя фамилии Липаков мог быть еще и пекарем. Согласно другой, менее вероятной гипотезе, прозвище восходит к названию дерева липа. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Липак, со временем получил фамилию Липаков.