Фамилия Липатёнков образована от имени собственного и относится к распространенному типу славянских фамилий. Основой фамилии Липатёнков послужило церковное имя Ипатий. Фамилия Липатёнков образована от имени Липат, которое представляет собой адаптированную русскими форму греческого крестильного имени Ипатий. В переводе на русский язык оно означает «высочайший». Одним из покровителей этого имени является угодник Божий Ипатий, прозванный Чудотворцем за то, что исцелял различные недуги и изгонял бесов. Вероятно, фамилия Липатёнков изначально возникла на территории Украины или Белоруссии, о чём свидетельствует характерный суффикс -ёнко. О точном месте и времени возникновения фамилии Липатёнков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Липатёнков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.