Фамилия Липатьева образована от мужского имени Липатий — это народная, адаптированная форма греческого крестильного имени Ипатий. В переводе с греческого «Ипатий» означает «высочайший», «самый высокий». То есть в основе фамилии лежит не прозвище по ремеслу или внешности, а церковное имя, которое давали при крещении. Потомок человека по имени Липатий со временем получил фамилию Липатьев, а её женский вариант — Липатьева.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русских фамилий: суффикс -ев присоединяется к основе имени, оканчивающейся на -ий (Липатий → Липатьев). Суффикс -ев, а не -ов, появился потому, что основа заканчивается на мягкий согласный. Фамилии на -ев обычно принадлежали к разным сословиям — и крестьянам, и духовенству, и дворянству, поэтому по одной только форме нельзя определить социальное происхождение рода.

Имя Ипатий в святцах встречается редко, но известно благодаря нескольким раннехристианским святым, например мученику Ипатию Чтецу. В русской традиции имя упростили до Липатия, отбросив начальный звук «и» — так же, как из Игнатия получился Лигнат, а из Иоанна — Иван. Фамилия Липатьева встречается в основном в центральных и южных регионах России, а также в Поволжье, что указывает на её давнее бытование в крестьянской среде.

Родственные фамилии — Липатов, Липатников, Липатьев. Все они восходят к одному корню, но различаются суффиксами: -ов, -ник, -ев. Липатьева — самая прямая и буквальная форма от имени Липатий, без дополнительных прозвищных суффиксов.