Фамилия Липатин — одна из тех, где за привычным русским звучанием скрывается греческое церковное имя. В её основе лежит имя Липат, которое в народе получилось из канонического Ипатий. В переводе с греческого это имя означает «высочайший», а его небесным покровителем считается святой Ипатий Чудотворец, известный тем, что исцелял болезни и изгонял бесов. На Руси верили: назови ребёнка в честь праведника — и его жизнь пойдёт под защитой свыше.

Сам суффикс -ин указывает на принадлежность: Липатин — это «сын Липата», «из семьи Липата». Такая модель в XV–XVI веках сначала закрепилась в среде людей зажиточных и знатных, а потом распространилась шире. Важно, что фамилия образована не от распространённого полного имени, а от его разговорной, усечённой формы. Это говорит о том, что в быту имя Ипатий звучало иначе — проще, по-свойски, как Липат.

У фамилии есть и другая, менее очевидная версия происхождения. В некоторых говорах «липать» означало «медлить, копаться, делать что-то вяло». От такого прозвища тоже могла пойти фамилия Липатин. Но эта гипотеза уступает основной: слишком сильна традиция крестильных имён в русском ономастиконе, и слишком много фамилий образовано именно от церковных календарных форм.

Однокоренных фамилий немало: Липатов, Липатьев, Липатников. Все они отталкиваются от того же корня, но с разными суффиксами. Липатин стоит в этом ряду особняком: суффикс -ин здесь более архаичный, он чаще встречается в северных и центральных русских землях. Так что если ваши предки — Липатины, велика вероятность, что их корни уходят в те регионы, где имя Ипатий было в ходу и где его переделали на свой лад.