Фамилия Липатских — яркий представитель северорусской модели фамилий на -их/-ых. В Центральной России и в южных регионах такие фамилии почти не встречаются, а вот в Архангельской, Вологодской, Вятской губерниях они были нормой. Суть этой модели в том, что фамилия застыла в форме родительного падежа множественного числа: Липатских буквально означает «из семьи Липатко» или «из дома Липата».

В основе лежит имя или прозвище Липат. Скорее всего, это народная, просторечная форма крестильного имени Ипатий. В русском языке имя Ипатий часто редуцировалось до Ипат, а под влиянием аканья или диалектного произношения превращалось в Липат. Такая замена начального «и» на «ли» — явление нередкое в народной этимологии: имя становилось понятнее, созвучным со знакомым словом «липа» или «липать» (вязнуть, приставать). Впрочем, полностью исключать версию от прозвища Липат, связанного с липой (например, человек, живший у липовой рощи), тоже нельзя, но церковное происхождение выглядит убедительнее.

Фамилия Липатских — сравнительно поздняя по времени закрепления. В отличие от дворянских или ранних купеческих фамилий на -ов/-ин, она оформилась в крестьянской среде, часто уже после отмены крепостного права, когда бывшим крепостным массово давали фамилии по имени отца или главы семьи. При этом суффикс -их/-ых указывает на принадлежность к целому роду: не «сын Липата», а «из Липатовых» — то есть из одной большой семьи, клана.

Сейчас фамилия остаётся редкой. Её носители в основном живут на севере европейской части России, в Кировской области, Пермском крае, а также в Сибири, куда переселялись северные крестьяне в XIX–XX веках. Встречается и вариант написания Липацких — это результат упрощения произношения, когда «тс» переходит в «ц», что тоже характерно для северных говоров.