Фамилия Липаткин — наглядный пример того, как народная речь преобразует церковное имя. В основе лежит каноническое имя Ипатий (от греческого hypsistos — «высочайший»). Однако в повседневном обходе полная форма оказалась неудобной: её сократили до Липатка, отбросив начальное «И-» и адаптировав звучание. Суффикс -ка здесь не уменьшительный, а скорее обиходный, характерный для просторечных вариантов крестильных имён (ср. Гришка, Мишка, но с заменой корня).

Фамилия образована по стандартной восточнославянской модели: к основе Липатк- добавили притяжательный суффикс -ин, означающий «чей?» — то есть «сын Липатки» или «из семьи Липатки». По этой же схеме сложились тысячи русских фамилий от неполных форм имён: Тимохин, Степанкин, Афонькин.

Спорный момент: не путать Липаткина с фамилиями от названия дерева липа (Липов, Липкин, Липатов). В данном случае корень другой — он восходит именно к имени, а не к растению. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные случаи отнесены к группе фамилий от производных форм календарных имён, где «Липат» — один из вариантов Ипатия.

Географически фамилия встречается рассеянно: её фиксируют в центральных областях России, на Волге и в Поволжье, но без ярко выраженного гнезда. Это говорит о том, что предки Липаткиных не составляли замкнутой крестьянской общины с единым прозвищем, а расселялись отдельными семьями.

Сословная принадлежность неоднородна: в XIX веке Липаткины записаны и как государственные крестьяне, и как мещане в уездных городах. Судя по отсутствию дворянских гербов, фамилия не относилась к привилегированным родам, а оставалась в среде податных сословий.

В современных справочниках фамилия Липаткин — нечастый, но устойчивый антропоним. Её ценность для этимолога в том, что она сохранила живую разговорную форму имени, которую книжная традиция почти вытеснила.