Фамилия Липендин (в женском роде — Липендина) принадлежит к распространённому типу русских фамилий, образованных от имени или прозвища. В её основе лежит слово «липень». В белорусском и украинском языках «липень» означает «июль» — месяц цветения липы. Это мирское имя, которое ребёнку могли дать по названию месяца рождения, что было обычной практикой у славян до повсеместного введения христианских имён. Таким образом, первый носитель этого имени — человек, родившийся в июле.

Однако есть и другая версия. Фамилия могла возникнуть от прозвища, связанного с профессией. Украинское слово «липник» (или «липенник») обозначало лепщика, гончара — мастера, работающего с глиной. В этом случае основатель рода Липендиных занимался гончарным делом: лепил горшки, миски и другую утварь. Такие прозвища по ремеслу часто переходили в фамилии, закрепляясь за потомками.

Модель образования фамилии проста и понятна: к основе «Липенд» (которая является вариантом корня «липен» с наращением -д-, типичным для русской народной речи) добавился суффикс -ин. Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Липендин, то есть сын или потомок Липеня (или Липенды). Это один из самых продуктивных способов образования русских фамилий, наряду с суффиксом -ов/-ев.

О точном месте и времени возникновения фамилии Липендин говорить сложно — процесс формирования фамилий у крестьян и мещан был длительным и завершился в основном к XIX веку. Но её корни ведут в юго-западные регионы, где были распространены украинские и белорусские говоры. В отличие от многих фамилий, которые «застыли» в одной версии, Липендины несут в себе двойную загадку: календарное имя или ремесленное прозвище. Оба варианта равноправны, и окончательный ответ может дать только семейная история конкретного рода.